Le jour de sa naissance, Théo est remis à l'adoption par sa mère biologique.
C'est un accouchement sous X. La mère à deux mois pour revenir sur sa décision...ou pas. Les services de l'aide sociale à l'enfance et le service adoption se mettent en mouvement. Les uns doivent trouver celle qui deviendra sa mère adoptante. Les autres doivent s'occuper du bébé en attendant que les décisions se prennent. Théo est placé chez Jean (Gilles Lellouche), un père de famille aimant et doué pour les soins des petits. Quant à Alice (Élodie Bouchez), elle se bat depuis dix ans pour accueillir un enfant. Mais suite à une séparation, comme mère célibataire, elle n’est pas sûre d’être retenue. PUPILLE est l'histoire de la rencontre entre Alice, 41 ans, et Théo, trois mois.
